Benchling 工作坊实录:用 AI 智能体在 Opentrons Flex 上写协议、跑实验并分析数据
Benchling 团队在 AI Science Summit 2026 Build Day 的工作坊中演示了在 Benchling AI 内用智能体完成实验全流程:用自然语言描述实验,智能体编写 Opentrons Python 协议、推送到模拟器检查错误,通过后在真实的 Opentrons Flex 上运行,再用同一智能体分析模拟的 96 孔板数据。
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Benchling 团队在 AI Science Summit 2026 Build Day 的工作坊中演示了在 Benchling AI 内用智能体完成实验全流程:用自然语言描述实验,智能体编写 Opentrons Python 协议、推送到模拟器检查错误,通过后在真实的 Opentrons Flex 上运行,再用同一智能体分析模拟的 96 孔板数据。
想深入理解扩散模型与基于流的语言模型的人必读 如何在没有教师模型的情况下训练一步语言模型 文章从并行解码为何困难讲起,带你了解流匹配与Beckmann传输,全程配有可视化!
LangChain 在博客中介绍用开源 wiki 编译器 OpenWiki 作为智能体的持久记忆层,并叠加证据图,让回答可追溯到支撑段落。
Ai2 介绍研究者如何基于开源模型 olmOCR 2 处理历史与考古档案。历史学家 Maurice Casey 在本地运行 olmOCR 2,构建 ArtificeOCR 并接入 Tropy,使自 2019 年以来积累的档案照片可关键词检索,同时避免把档案材料上传第三方;他也报告模型在训练数据覆盖较少的语言手写体上会出现错误。
入选理由两个团队分别把 olmOCR 2 用于历史手稿与考古陶器记录,给出了可复现的本地部署与微调路径,适合处理受限档案的研究者参考。
📄 长文档,本地处理。 很高兴看到 @atomic_chat_hq 在 Mac 上运行 MiniCPM-OCR 1.0,并与社区分享 GGUFs!感谢这次实操演示。💻🚀
A 1.2GB model on a Mac read Anthropic's whole IPO 📄 @OpenBMB MiniCPM-OCR 1.0 went through all 415 pages of Anthropic's S-1 on an M5 Max MacBook at about 4 seconds a page and nothing ever left the laptop GGUFs -> https://huggingface.co/AtomicChat/MiniCPM-OCR-1.0-GGUF
非常感谢 @atomic_chat_hq 的精彩演示!🙌 他们在 M5 Max MacBook 上本地运行 MiniCPM-OCR 1.0,处理了 Anthropic S-1 文件的全部 415 页——模型仅 1.2GB,每页约 4 秒,零数据离开设备。 小模型,严肃的文档理解,完全本地。🔥
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SciSpace 发布对比文章,区分 Parallel API 与 SciSpace API 的适用场景:前者面向企业信息补全、供应商比较和通用网页研究,后者面向需要原始论文、研究细节提取、筛选和带引用综述的文献研究产品。
Consensus API 按可计费调用收费,符合条件的套餐额外用量为每次 0.05 美元,即 1000 次额外调用 50 美元,不含订阅费和套餐内额度。免费额度为每月 30 次调用,搜索按每返回 100 篇论文计一次调用,自助速率限制为每账户每秒一次请求。SciSpace API 仍处早期访问阶段、尚未开放,需填写申请表申请。
很高兴看到 MiniCPM-OCR 接受实测!🔥 非常感谢 @wikiwayne 做了详尽、透明的对比,并分享了结果和注意事项。💙 期待你在 GX10 上跑完本地测试后的表现。这样的真实反馈正是我们持续改进的动力!🚀
https://x.com/i/article/2113799358797811712
HuggingFace 发布四场分享、圆桌与问答,延续其免费课 Training Agents,聚焦工业侧 Agent 训练实现。Miles 在 Terminal Bench 2 上用 64×B300 完全异步训练大 MoE,约 100 步后奖励从约 0.44 升至 0.56;OpenEnv Arena 从约 9 万个可找到的 RL 环境中筛出约 800 个较干净环境。
last week we closed the Training Agents series IRL at the GitHub offices in SF 4 talks, a panel and audience Q&A. almost 2h on post-training agents with open models > Learnings from enterprise RL (@t2govind Microsoft) > Environments and benchmarks in industry (@VBarres86633 Mercor) > How to train your agents with Miles (@nblintao RadixArk) > Why we built OpenEnv Arena (@xdotli BenchFlow) full recording + slides https://www.youtube.com/watch?v=CKFUx7COIwQ
你也可以学会像 @allietheicon 那样 Jev! 全新 cookbook 每周火热上新。
One of my favorite Jev patterns is "line-by-line search", where you put an entire document in state, and ask a question for each line (or paragraph). This is super useful when you want to find the most relevant line for a query. Use nouls when you expect one dominate answer, use scores when you want to highlight lines by overall relevance. The former is good for answering a specific question while the latter is good for finding all relevant passages.
10 月 24–25 日在旧金山 Studio 45 举办的第七届硬件黑客松吸引 6 支团队,围绕 BioKEA 样本制备、Opentrons Flex 液体处理与 200 美元以下开放搭建三条赛道,24 小时内全部交付演示,RoboSwap 获总冠军。
斯坦福CS329Z课程第10课由Alex Shaw与Ryan Marten讲解Terminal-Bench和Harbor,主张软件工程正从"规则是真相"转向"评测是真相",Evaluator成为新角色。
CS 329Z: Engineering AI Agents Stanford / Fall 2026 @stanfordnlp https://cs329z.stanford.edu/ 课程定位:从"模型"到"系统"的工程学 覆盖:简单 LLM 流水线 → 复合 AI 系统 → 自主 Agent。三位讲师的背景也高度互补: @Diyi_Yang(斯坦福 NLP 教授,人机交互与社会计算方向) @michaelryan207(DSPy 核心贡献者,自动评估 AutoMetrics 作者) @jyangballin(SWE-agent / SWE-bench / SWE-smith 作者,软件工程 Agent 领域最重要的研究者之一) # 课程主线:三大工程挑战 贯穿全课的三个核心问题——分解(decomposition)、数据(data)、评估(evaluation)。11 周的内容基本围绕这三条线展开,可以分为五个模块: 模块 1:构建基元(Week 2–3) · LLM 作为构建材料:API/SDK(litellm)、结构化输出、约束生成、解码策略、test-time compute、上下文工程、模型选型与成本/延迟权衡 · RAG:embedding、向量库、分块策略、混合检索、cross-encoder 与 ColBERT 后期交互 · 工具调用:函数调用 API、MCP(Model Context Protocol)、工具设计、代码沙箱、错误处理与重试 模块 2:框架与设计模式(Week 3–5) · 框架层:DSPy(signature / module / optimizer)、LangChain/LangGraph、LlamaIndex,重点是"框架抽象了什么 vs. 你手写了什么" · 设计模式:workflow vs. agent 的分类学,五种可组合 workflow 模式,ReAct / plan-and-execute / reflection,"scaffold(脚手架)本身就是设计决策" · 记忆架构:短期/长期记忆、记忆作为工具动作、文件系统作为外化记忆、跨 Agent 记忆(MemGPT、Mem0、Generative Agents) · 多 Agent 系统:编排模式、handoff 与状态传递,以及一个很有态度的对照阅读——既读 AutoGen,也读《Why Do Multi-Agent LLM Systems Fail?》和 Neubig 的《Don't Sleep on Single-agent Systems》 模块 3:优化(Week 5) · 从提示词到微调的全景:GEPA、MIPROv2、OPRO、TextGrad(提示优化);LoRA/QLoRA、蒸馏、RLHF/DPO(权重优化);test-time scaling(推理算力) · 核心问题是决策框架:什么时候优化 prompt、什么时候优化 weights、什么时候堆推理算力 模块 4:数据与评估(Week 6–8)——最有分量的部分 · 数据:trace、demonstration、feedback 三类数据;训练数据 vs. 评估数据;数据飞轮;合成数据;从 Agent 轨迹构建数据集(SWE-smith) · 评估基础:为什么 eval 难;4 元组框架(request / environment / stopping criteria / scorer);好 benchmark 的性质;tinyBenchmarks · 评估基础设施:三类 grader、LLM-as-judge 的 prompt 设计与已知偏差、pairwise vs. pointwise、非确定性指标 pass@k vs. pass^k、harness 设计 模块 5:安全与前沿(Week 8–11) · 安全:工具访问的隐私风险、prompt injection(含间接注入)、红队、沙箱与权限模型、输出护栏、human-in-the-loop · Coding Agent:SWE-agent、Claude Code、OpenHands 的端到端架构对比 · 主动式 Agent:从 reactive 到 proactive,General User Models(GUM)、Next Action Prediction,以及"Agent 何时应主动、何时应等待"的 mixed-initiative 问题 · 开放问题:多模态/web/计算机使用 Agent、科学 Agent、长时运行架构、生产可观测性(tracing、monitoring、成本管理) # 作业设计:一手建、一手评 HW1:从零构建 Agent 系统(10%) 给定论文库,构建能检索并推理回答科学问题的 Agent。 · Part A:只用 litellm 手写 RAG + 工具调用 + ReAct 式 Agent 循环 · Part B:用 DSPy 重建关键组件,并反思框架抽象了什么 HW2:评估一个 Agent(10%) 给定一个预构建 Agent,设计完整评估套件:代码型 grader、至少一个 LLM-as-judge、用 4 元组框架构建 benchmark 任务、错误分析。
Tavily 的 API Key 需在仪表盘创建并保存在后端,通过 Authorization: Bearer 头认证 Search 请求。每月含 1,000 免费 credits 且无需信用卡,按量付费为每 credit $0.008;开发密钥一般限 100 请求/分钟,生产密钥一般限 1,000 请求/分钟。
SciSpace 发布 PubMed API 教程,演示如何用 Python 调用 NCBI E-utilities 的 ESearch、EFetch 与 ELink 完成检索、抓取引文与摘要及解析 PMC 关联。
SciSpace 发布 Semantic Scholar API 指南,覆盖 Python 调用、API Key 申请与 Graph 端点用法。文档显示入门配额为每秒 1 次请求,匿名访问共享每秒 1000 次请求池;指南强调这是文档核对的操作示例,未做延迟或成功率基准测试。
Sebastian Raschka 开放「Build a Reasoning Model (From Scratch)」配套完整编程课,共 11 小时视频,从预训练小 Qwen3 0.6B 起步,用 Python/PyTorch 手写 verifier、推理时扩展、GRPO 版 RLVR 与蒸馏。
The complete reasoning-from-scratch video series is now up (and linked) here: https://magazine.sebastianraschka.com/p/building-reasoning-models (Taking a short break but will be back with LLM model and research updates in November!)
OpenAI 已于 2026 年 7 月 23 日下线 o3-deep-research 和 o4-mini-deep-research,以 gpt-5.6-sol 经 Responses 接口替代;SciSpace API 仍处早期访问阶段,需通过申请表获取。
Every 的 Dan Shipper 实测了 Anthropic 的常驻智能体 Duet,认为它是目前最好的个人智能体。Every 平台负责人 Willie Williams 则解释了团队为何放弃早期的个人智能体实验,改为全团队共用一个智能体。
我们如何评估 AI 在不同领域中的潜在能力?今天下午 3:30,来 #EMNLP2026 Google 展台(#D5),与 Vinodkumar Prabhakaran、Piyawat L Kumjorn 和 Sunipa Dev 一起观看现场演示,了解如何将指标操作化并映射真实世界用户查询失败案例。@GoogleDeepMind
作者用 9 个品类共 31 条 query 实测腾讯元宝搜索,每次返回 10 条结果,认为其在政府、统计局等权威信源和金融时效性上表现较好,且直接返回正文可减少 Agent 的抓取调用。
由 Abhinav Nellore、Johannes Schmitt、Soledad Villar 和 Rachel Ward 发起的 oai-math-revised 项目,旨在改进 OpenAI 数学文稿中难以理解、引用不完整的问题,并邀请学生、博士后、教授及爱好者参与。
正文实际内容为网站 Cookie 说明,未包含 TinyFish 的架构细节、版本、数据或可用范围,无法据此写出可核验的摘要。
SciSpace 发布指南,介绍如何用 Python 调用 ClinicalTrials.gov 官方 REST API 以 JSON 获取试验注册数据。NLM 的公开检索示例不提供 API Key,并将该服务描述为开放获取,但官方材料未给出具体速率限制数值。指南演示用 pageToken 翻页,NLM 记录默认每页 10 条研究,并提醒经典 API 已于 2024 年 6 月 25 日退役。
arXiv API 是免费检索论文元数据与摘要的接口,官方公开检索流程无需 API Key,返回 Atom 1.0 XML 而非 JSON。速率限制为每 3 秒一次请求、单连接,且在你控制的所有机器上共享;官方文档标注结果上限 30000 条、每页最多 2000 条,而 arxiv.py 文档称每查询 30 万条,两者存在冲突。
SkyRL 团队称在 B200(约 178 GiB)上通过四类系统优化,把 GLM-5.3-Flash 的单序列训练长度做到 100 万 token,峰值约 144.5 GiB,约为开箱 Megatron 基线的 64 倍。
Super excited to share some of the work I’ve been doing on supporting 1M token context training on SkyRL for GLM 5.3 Flash, 64x higher than the out of the box Megatron baseline! 🚀 This work was done in collaboration with the amazing folks at @LilaSciences! 🤩 Getting there took key algorithmic and systems optimizations in four main areas: 1) DeepSeek Sparse Attention: run DSA on a sparse kernel; chunk and shard its quadratic indexer. 2) Activation recompute and offloading: recompute activations in backward and offload saved inputs to CPU. 3) Context parallelism: split each sequence across GPUs, with new CP support for KDA and a fix for DSA. 4) Avoiding unnecessary precision upcasts: keep FP32 copies out of memory and off the network. For more details on our implementations and our results, check out our full technical blog here: https://blog.skyrl.ai/blog/1m-context-glm-5-3-flash! This work benefited from the contributions of many people along the way. Big thanks to @pcmoritz, @erictang000, @sumanthrh, @CyrusHakha, @richliaw from @anyscalecompute and Keith Truongcao, Tushar Khot, Vivek Subramanian, Semih Kara from Lila Sciences for all the help and guidance!
Datalab 开源文档解析器基准 OmniParseBench 以 16,288 项通过/失败测试覆盖 2,937 页文档,并公布 27 个解析器的判定结果。该教程基于这些判定重建排行榜,发现排名前两位的解析器在统计上并列,且多数文档切片上领先者会变化。作者还在 50 页样本上自行运行 Tesseract 与 Indra OCR,并指出一项发布数字与公开文件不符。
alphaXiv 发布了一份可解释性图解指南,从早期计算机视觉研究讲到语言模型,梳理特征可视化、SHAP 与积分梯度、电路追踪,以及注意力头、残差流、激活引导、消融与探针实验、多义性与 SAE 等方法。指南还讨论了该领域的局限与开放问题,并回应了近期走红的文章 Neural Networks Are Already Clean 引发的争论:我们是否真在接近逆向工程 LLM。
SciSpace 发布研究研讨会指南,建议按研究逻辑组织报告而非照搬论文结构,10 分钟报告可从约 10 张幻灯片起步。指南要求标题页写明研究内容、姓名、机构与日期,引言交代问题与空白,并明确陈述研究问题与假设。方法部分需说明研究设计、样本量、重复数、变量与统计方法,并配实验设计示意图。
SciSpace 发布的研究指南对比了概念型论文与实证型论文:前者依靠现有文献、理论视角与逻辑推理发展或修正概念框架,后者通过实验、调查、访谈或数据集等系统收集的证据回答研究问题。指南指出两者在主要目的、证据基础、原创贡献与评价标准上存在差异,但这些区分并非绝对规则。